Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms