Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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