Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms