Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms