Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms