Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsndQ8VIM4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms