Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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