Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms