Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030452D12RikQ8CD33 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms