Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms