Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms