Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf6Q62311 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms