Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms