Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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COL24A1Q17RW2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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COL24A1Q17RW2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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COL24A1Q17RW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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