Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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