Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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