Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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