Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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