Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms