Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms