Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms