Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms