Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms