Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms