Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms