Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Triml2E9PW10 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Triml2E9PW10 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms