Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms