Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms