Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CrotQ9DC50 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms