Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkar1aQ9DBC7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkar1aQ9DBC7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms