Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Borcs5Q9D920 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Borcs5Q9D920 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Borcs5Q9D920 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Borcs5Q9D920 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms