Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1lQ9D1E5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms