Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD1Q8NHV4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms