Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne4Q8CII8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne4Q8CII8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms