Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms