Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bcas3Q8CCN5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bcas3Q8CCN5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bcas3Q8CCN5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bcas3Q8CCN5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas3Q8CCN5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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