Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aph1bQ8C7N7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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