Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NfascQ810U3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfascQ810U3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfascQ810U3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NfascQ810U3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfascQ810U3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms