Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms