Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms