Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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