Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms