Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms