Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxa5P09021 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms