Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms