Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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