Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrklB2RRL2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms