Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms