Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms