Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbe1Q9D6Y9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms